内镜中心于2022年5月16日开诊，位于外科大楼负二楼，设有胃镜检查室、肠镜检查室、纤维支气管镜检查室。

科室拥有奥林巴斯、富士高清电子胃肠镜系统、高清纤维支气管镜系统、康威氩气高频电刀。严格按照国家卫健委内镜清洗消毒规范进行内镜清洗消毒。拥有技术娴熟、精益求精、服务优良的内镜诊治团队，内镜诊治医生为脾胃病科、普外科、肺病科派遣。

能熟练开展电子胃肠镜、无痛胃肠镜、纤维支气管镜检查，胃肠镜下消化道息肉切除(APC、EMR)、异物取出、胃空肠营养管置放、消化道出血镜下止血、消化道恶性肿瘤内镜诊断，胃镜下食管静脉曲张套扎术，肠镜下内痔硬化术，肺泡灌洗、刷检、活检术等。