重庆市巴南区中医院于2015年12月开始开展风湿病诊疗活动，2018年9月设立风湿病门诊，2019年4月风湿病科独立成科。2020年12月底风湿病科门诊搬迁至门诊大楼二楼内科诊区，病房设在内科住院大楼三楼。

科室现有医护人员12人，高年资中级职称1人，医学硕士2人，风湿病专科护士1人。风湿病科配有中药熏蒸仪，中药离子导入仪、中频治疗仪、蜡疗机等中医治疗设备。科室专注于风湿痹痛的中西医结合治疗，如类风湿关节炎、骨关节炎（手关节、膝关节、颈椎、腰椎、髋关节）、痛风、干燥综合征、风湿热、白塞病、硬皮病、老寒腿、产后风湿、骨质疏松、系统性红斑狼疮、强直性脊柱炎等风湿病，常年开展针灸理疗、中药隔物TDP、中药蜡疗、中药离子导入、中药溻渍、中药药浴、中药熏蒸、穴位贴敷、药罐等治疗。